拜谱生物

400-820-8531
News center
拜谱生物
首页 > 拜谱生物 > 市场活动 > 推出上线|乳硝化作用的实现逆袭周围人,衣康硝化作用修饰语蛋白质组整体实力强势回归!

新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

老是充当化工行业食材而被耳熟能详的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“消化吸收废料”成了“秘宝小碳原子”的辛酸史经历类同,是直到近四十多年才被挖掘其很重要的海洋生物能力,因此“坐起农奴把演唱”,越来越是在免疫系统宫颈慢性炎症性问题科研业务领域内独树一帜。至今几篇毕业论文简报了在各式宫颈慢性炎症性问题的动物界模板中享受衣康酸或其化学工业呈现衍海洋生物的进行治疗益处,并挖掘其不确定靶点。对于衣康酸的“下一世”与“今生今世”,详情软文《乳酸的奋斗史弟兄——衣康酸!选文兜兜风熟知衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用掩盖蛋清组学产品,实现1000+玄之又玄度绘制位点查出,比较稳定初现特色靶点,全方向生信研究分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“会发现”到“查证”全操作流程工作,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、调查流程图

02、场地实测信息

03、经“点”显现

在亲测的数据中,排除许多文献资料中通讯稿的经典英文靶点简答衣康酸遮盖位点,如第一名个被发觉的衣康酸共价遮盖核淀粉酶质KEAP1,也有糖酵解径路中的3个的关键所在酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,和炎性小体结构核淀粉酶质NLRP3和内部萎缩期间中的的关键所在核淀粉酶质RIPK3等,其质谱图如表图如下图所示。

04、的产品性能

1.诸多质控

工商品化非特异朋友探头孵育、SDS-PAGE查重、WB查证、模本涉及到性了解等各位置查重,保证 产品后果正规性。

2.高安全性能质谱议器的平台

在Orbitrap Astral全新第九代高粪便质谱仪金刚萨垛下,变现衣康酸性反应绘制位点及球蛋白检验新深度的,助推器科学实验研发新遇到。

3.全流程图一趟式产品

应用于拜谱微生物更加完善的调查app平台,可给出“受损细胞的培养→测试探针孵育→WB加测→高妙度衣康过酸修饰语加测→专有生信探讨→相关位点PRM查证”全程序服务于,省时省劲、方便更实惠。

05、具体分析玩法(一些)

06、用领域

PART 2、期刊论文分享图片

医学文献一

英语翻译问题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

常常主题词:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

探究东西:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

专著二

英文版主题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

繁体中文宝贝标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

调查主要内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、典型案例衍生物思绪

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具备着很强的底物根据特性,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物技术衣康酸性反应突显组试验数据显示中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康碱化遮盖(以下的图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结ppt

是 TCA间歇中的在期间排泄物,衣康酸调节管控排泄、免疫系统性力和的患病期间的相互间角色,为诊疗免疫系统性力的患病性的患病提高了改用诊疗管理策略。衣康酸格局中的亲电性α,β-不饱和状态羧酸格局能对核膳食纤维上的催化活性半胱氨酸残基完成烷基化突显语(迈克尔加持的反应),这译员后突显语被誉为“衣康酸突显语(itaconation)”,以求应响核膳食纤维工作,调节管控免疫系统性力回复和排泄有效途径,为多类的患病性药物生产制造提高新策略。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化装饰蛋清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物分子生物学肯定化学发光法靶向治疗排泄组(QMT1000)或电量分泌靶向疗法分泌组品牌对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参照文献

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物