
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抵抗能力聚集MHC和其结合起来肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到天然免疫肽回文序列和全文翻译后装饰数据信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo从头至尾测序科技,不依赖现有数据库,越来越高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且极为丰富的统计数据深入分析方面为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递恶性肿瘤抗原的路线
NO.1 科学实验方法
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情况研究
01 策略探索
短文考题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
发稿期刊:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)是一种种核传输蛋白酶,在癌症复发中老是过表达出来,逐项为肉瘤产生的安装驱动缘由。现有,靶向用药XPO1的小原子核正被用做诊疗治癌用药。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用抗体肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 那种隶属于XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 肺部肿瘤-免疫力中药治疗
好文章选择题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
发过半月刊:Nature Communications IF:16.6 2023
恶变胸膜间皮瘤(MPM)都是种继发性恶意的入侵性恶性肿瘤。基于涉及的制疗设计不足控制效果,于是急迫须要新的制疗策咯。因为其T组织细胞侵及,我们如果MPM都是个适宜的制疗性癌病肺炎疫苗的关键。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用依托于质谱的免役肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶性肿瘤胸膜间皮瘤免疫细胞肽组学监测
03 大肠杆菌mRNA接种疫苗定制开发
软文小题目:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
刊出半月刊:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过立于质谱的免疫力肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌感化的Hela神经上皮细胞和HCT-116神经上皮细胞中鉴定结论MHC I呈递的抗原肽。
拜谱个人总结
天然身体的抗体能力化肽组学是血清质组学的一些怏速发展进步的层次结构,它针对于理论研究天然身体的抗体能力化系统化中由重点机构混溶性pp体(MHC)或人类白神经元抗原(HLA)碳原子呈递的天然身体的抗体能力化肽。这部分天然身体的抗体能力化肽是神经元表面层呈递的肽段,是可以被T神经元辨认,导致勾起天然身体的抗体能力化症状。特征提取质谱的天然身体的抗体能力化肽组学就被选为司法司法鉴定MHC血清呈递肽的金规则的方法,是可以一直司法司法鉴定不一样女性生理和疾病程序下不一样机构和神经元结构类型中的天然身体的抗体能力化肽组,举个例子三维线瘤或木马染上的神经元。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋清组学、细胞代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的抗体肽组加测服务的,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,可能正确且之间提拱免疫检测系统肽回文序列,感觉比较多非典型性免疫检测系统肽,层层落实挑选出可以信赖新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
基准医学文献
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y