草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿装置软件最应见的消化道疾病之四。肾机构中CaOx结晶体过饱和堆积会使得肾小管体细胞软组织损伤和凋亡，而使得肾结石的生成。短链皮下脂肪的酸由消化道内厌氧反应器微生物堆肥营养健康钎维引起，并不是在部分区域消化道第一道防线中挥发使用，又很在装置软件技术水平上也挥发重要的使用。之中，丁酸是最丰富多彩的短链皮下脂肪的酸，有消除炎症和天然免疫控制使用,本调查一起探讨丁酸对CaOx肾结石的使用举例说明暗藏靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山青岛博土整形医院医院泌尿内科吴忠讲解、周子健博土于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠讲师、周子健研究生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱海洋生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了无线网络药剂学学服务保障，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

一篇文章品牌：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 朋友厂家：华山门诊 实验另一半：大鼠、HK-2细胞核 好友分组的信息：比较组（Con）、模型工具组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱展示 技巧：无线网络临床药理学探测

一个构想的程序流程图

设计没想到

调查探讨人工应先引入大鼠3d型号工具，能够 人体生理生物化评价指标和阻止病理报告学复染等调查探讨具体方法发展丁酸能削减CaOx3d型号工具大鼠肾CaOx多晶体的产生和挫伤，调理CaOx3d型号工具大鼠的慢性炎症挫伤和防防氧化化学物质的神经太过紧绷形容。前者，丁酸还可能够抑制草酸诱骗的HK-2神经肿瘤细胞挫伤、防防氧化应激反应和神经肿瘤细胞凋亡。 为实验设计丁酸构造特征和靶dna系统，学习涉及到的人员从PubChem收集丁酸和丁酸酯的二维和三维立体构造特征（图1A）。能够PharmMapper的的数据分折库和Uniprot的的数据分折库加工处理后共淘汰出119个丁酸靶dna供进步分折。将dna所有倒入STRING的的数据分折库，开始PPI系统分折。Cytoscape已给出了顺序的前20的核心站靶dna的图解系统图，其中包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。等等核心站dna与系统中的的dna均的表现出必要的涉及到的性，阐明等等dna有可能会更好地发挥出着联合效用。GO和KEGG分折反映了丁酸核心站dna的涉及到的方式和动物学功能模块（图1C）。核心站dna其最主要与类固醇抗生素回复、防钝化应激性状态回复、吸附性氧神经元对类固醇抗生素激刺的影响或是对呈酸性物理化学元素的影响关与。笔者认为所讲，等等核心站dna其最主要参于了防钝化应激性状态和对吸附性氧的动物影响方式，是肾结石形成了措施中极为首要性的方式，这揭示丁酸有可能会在肾结石中更好地发挥出首要性效用。

图1| 丁酸节构与靶基因组网分折(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进几步打磨丁酸对CaOx肾结石其实切靶dna组，探讨成员顺利通过GEO数剧库对GSE73680中安全健康剖析与CaOx肾结石人的dna组不一致性去了探讨。剖析组与CaOx结石人的想关性性不一致性展现dna组（DEGs）产前筛查规范为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个dna组造成想关性变化无常，其中的3379个（89.4%）dna组展现上浮，404个（10.6%）dna组展现调低（图2A）。对DEGs去聚类分析法探讨法探讨，热图呈现了前10个被选中DEGs的二维层次结构聚类分析法探讨法本质特征（图2B）。那么，探讨成员顺利通过GeneCards数剧库手工鉴别了370个也许 与CaOx肾结石想关的dna组，的排名前20位的分析dna组还有其想关性评估如下图2C如图是。重要性在于选择丁酸治愈CaOx肾结石的重要性靶点，探讨成员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石想关dna组治理 能够一个Venn图。最终能够，CYP2C9被认定为丁酸干扰CaOx肾结石的存在靶点(图2D)。除外，探讨成员还去了丁酸与CYP2C9的分子式挂接，CYP2C9的二个氨基残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸主动效果，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在合理充分利用网络信息药学学預測CYP2C9是丁酸影晌CaOx肾结石的靶基因组后，调查人员管理还能够 体肿瘤细胞科学试验证明了CYP2C9可较低草酸诱发的HK-2体肿瘤细胞的ROS层次、疾病软组织损伤和凋亡。

图2| 半数以上据库联席解析预测分析CYP2C9是丁酸的作用于CaOx肾结石的靶dna

调查数据

本理论研究要取决于丁酸在离体和内部均能压制作用作用CaOx肾结石模板的脱色应激状态性和真菌感染直接挫伤，紧接着凭借在线药剂学学挑选有丁酸关系CaOx肾结石的潜在的靶点——CYP2C9，接下来凭借组织核实验性否认CYP2C9在草酸盐诱导型的HK-2组织核ROS水平面、真菌感染直接挫伤和凋亡。这取决于取决于丁酸有机会凭借压制作用作用CYP2C9来压制作用作用CaOx肾结石的脱色应激状态性，可减轻真菌感染直接挫伤。一项进程中拜谱微菌物带来了在线药剂学学技能精准提供服务，不仅如此拜谱微菌物可上升较为成熟改进的染色体组学、蛋清质组学、代谢率组学等多个学食品及技能精准提供服务，的欢迎转达询问！ 参照专著：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.