
近日,广州医学院校生第1加盟医疗王学浩科学院院士团体在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶点体力分泌检测分析服务。
英语宝贝标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
2英文题目:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
买家组织:南京医科大学
研究方案产品:细胞
拜谱带来售后服务:转录组测序+蛋白酶互作组+靶向药物能量是什么产生组
能力路线规划:
实验可是
01、YBX1被鉴定费为HCC中糖酵解的要素人类基因
本探析搜集HCC癌肿样版(n=7)的单上皮组识RNA测序参数集开展定量概述,看见糖酵解灵活性一般集约化在癌肿上皮组识中,hdWGCNA定量概述辨别的出9个什么是基因电源模块(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的野外荒岛生存定量概述确实YBX1为独立的野外荒岛生存风险点方面(图1H)。进的一步运用IHC、WB检测和癌肿组识与毗邻非癌肿组识的空间转录组学参数集确认YBX1是肝上皮组识癌方法的隐藏靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确保为调高HCC细胞核糖酵解的至关重要方面
02、YBX1有助于HCC中的有氧糖酵解和增值
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗热量分泌组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1力促HCC中的有氧糖酵解和繁衍
03、OGT与YBX1切合并有利于YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,核蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1结合在一起并带动YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化有利于促进其磷酸性反应,而有利于促进其核转位
进三步判断YBX1的O-GlcNAc糖基化可不可以后果其磷碱化,在OGT敲低的HCC体细胞膜中或用OGT自动调节剂OSMI-1操作,YBX1蛋清关卡可观减轻,YBX1磷碱化可观减轻(图4A-C)。IP测试出现,在一致的Flag-YBX1底物关卡下,YBX1-WT的磷碱化关卡可观远远超出YBX1-T57A,取决于磷碱化的加入实际上仅是正由于更好的YBX1蛋清呈现(图4D)。溶合了核和质成分知道TMG操作的HCC体细胞膜中YBX1核呈现的变高(图4E-F),进三步知道YBX1磷碱化的关键的自动调节细胞因子是AKT(图4G-I)。这么多知道更加注重O-GlcNAc糖基化完成可以淡化其磷碱化来明显增强YBX1蛋清平衡性并可以淡化核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 体现有助于其进步骤时有发生磷碱化体现并要能促进会其核转位
05、YBX1促进会PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1驱动PKM2转录
06、YBX1 会增加组血清乳过酸突显水平方向
研发察觉到YBX1敲低不错减轻血清质乳酸性反应,更是是H3K18乳酸性反应(图6A-C)。糖酵解控剂型2-DG的进行实验断定了糖酵解与组血清乳酸性反应的间接相关联,控制糖酵解可不错减轻H3K18la的水平(图6D)。PKM2过体现爱不可逆转转YBX1敲低可致的H3K18la减少,到外源乳酸治理不但优化H3K18la,还产生YBX1体现爱上涨,表明存在的正方向评议(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR断定,H3K18la凭借生物富集于YBX1开机子间接促使其转录,该具体步骤受O-GlcNAc糖基化改善(图6H-J),并察觉到P300 上涨是YBX1增強H3K18乳酰化为用的新机制(图6K-L)。
图6.YBX1改善H3K18乳过酸遮盖技术水平
软文工作小结
在一项设计中报道范文了YBX1在HCC中高理解爱,或者与糖酵解迷切关于。YBX1在T57处被O-GlcNAc淡化,可以稳定性高血清质并加强其理解爱。哪一淡化还增进YBX1在T57处的磷酸性反应,增进其核易位。对此,哪一期间加强了糖酵解关于dna遗传的转录并兴奋乳酸的产生。除此之外,YBX1更改密码P300的转录,以致驱程组血清的乳酸性反应,专门是H3K18la,H3K18乳酸性反应单向自我调节YBX1dna遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传病正反两面馈环制度图
拜谱总结ppt
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱怪物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向药物养分新陈代谢组技术服务,拜谱菌物建立了完善成熟的转录组学、蛋白质组学、英译后体现组学、分泌组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
可以参考专著
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.