代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
的有效含量表检验：消化吸收组学科技设备也能对中葯中的物理有机化学好分表进行全面性具体分析，检验出药草中的亲水性的有效含量表。如，使用鉴于质谱（MS）的消化吸收组学科技设备，也可以检验出冬虫夏草中的冬虫夏草皂苷等亲水性的有效含量表。一些科技设备还也可以区分开药用价值价值和非药用价值价值一部分的物理有机化学符号物，为中葯的安全性能操控能提供依照。
服务产品品质掌控：对其进行分解产生组学技木，就能够对中药方材茶的服务产品品质对其进行鉴定和掌控。比如，采取绿色动植物分解产生组学具体分析，就能够定制开发争对类痛风性骨节炎的中药方材茶组成表的服务产品品质标签的催化发光法方案。不仅而且，分解产生组学还就能够分辨中药方材茶中的毒副作用组成表以及其毒副作用逻辑，如对其进行UPLC-Q-TOF-MS探析，划分其他乌头绿色动植物的催化组成表，并分辨具备有镇痛药活性酶类和急慢性毒副作用的生物技术碱。
2. 中药药效机制研究
反应靶点掌握：分解代谢组学科技能能有所帮助掌握中西药活性酶类因素的团伙靶点。随后，学习发掘雷公藤红素可借助调控Treg/TH1和Treg/Th17平衡点、阻绝NF-κB径路等规则引领抗感染反应。
效用共识体系化解读：排泄组学技能也能阐释中要的治疗病毒的效用共识体系化。举例，理论研究探讨遇到青蒿素耐药肺结核与疟原虫的线粒体排泄改进关于 ，非靶向药物排泄组学阐释了与该时关联的排泄物变动。前者，排泄组学还都可以能够 分享排泄物的变动，理论研究探讨中要复方的效用共识体系化。
3. 中药安全性评价
毒素共识策略的科研：分泌组学技巧也可以采用的科研西药的毒素共识策略。比如，进行分泌组学和16S rDNA测序的优势互补剖析，体现了了清益汤对病情比较重的时候慢性膀胱胰腺炎有关于慢性膀胱肺损坏的庇护共识策略，并选择了铁沉稳、差异化分泌物和微海洋生物菌群相互间的感情。
健康稳定考评：排泄组学能力还可应用于中葯配方的健康稳定考评，正常识别潜在性的的毒副作用组分和毒副作用靶点，故而为中葯配方的健康的卫生应用作为科学学根据。
4. 中医证候研究
证候涉及分解产生转化物了解：分解产生转化组学枝术不错用到分析方法与医学药学证候涉及的内源性分解产生转化物转化，輔助医学药学证候的检查和介入。列如 ，凭借分解产生转化组学研究方案，已在冠相思病女性中鉴定费出与痰瘀证随和阴两虚证涉及的生态学标制物。
证候矫治探讨：分解分解组学能力工艺还都可以用以探讨中药材对中医师证候的矫治效果好。举个例子，用分解分解组学能力工艺及聚类探讨法探讨法，知道“黄芪-茯苓-泽泻”等关系制剂剂量加配应用以肾病全方位的征的新组方制剂剂量，也能对几种肾病全方位的征有关的生态学标准物会产生影晌。
5. 多组学技术整合应用
几组学整理：代谢转化组学与某个组学工艺（如遗传基因组学、转录组学、脂肪酸质组学等）的整理用，为草药科研保证了好几回个多因素的概述框架图。此类整理用不单深刻了我们的对草药部分在碳原子方面上对人体组织顺利和病症的情形的关系，况且为具体分析草药的帮助工作机制和效果的物质的基础保证了了强力量的工具软件。
发病根治机理：多个学工艺可以使用于实验中药材根治发病的大分子机理。列如 ，利用血清质组学和分解组学的合作APP，阐述了与中医理论分级的膝骨节骨性骨节炎密切联系对应的不一致性表述血清和分解径路。
细胞代谢组学高技术在中草药方设计中的应用，为中草药方的当今化和靶向医辽出示了重要性的科学技术大力支持，这会有利于引领中草药方的标准单位化和国际联盟化趋势。