
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物学 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
实验最终结果
探析员工来探寻随之冷库精力延伸鸡肉的对抗强度、持反击式水轮机、光亮感、分离铁量、ROS、脂质过钝化物、MDA、GSH和GPX4程度来评估报告格式肌肉团队团队神经元的铁消失的状态。结局表明,冷库精力延伸后,鸡肉的对抗强度在第六天和第6天相关性增涨;持水专业能力缩减;色变深,失去了光亮,鲜网红调成暗网红。因此,分离铁、活力性氧和MDA的量相关性添加,神经元凋亡率相关性上升。 调查工人抽取不相同冷藏箱精力的背部全身肌肉合格品的蛋清质,接下来参与SDS-PAGE定性概述,蛋清质条带在不相同时代划分均衡且相拟(图1a)。随着蛋清在不相同合格品中的表述现状,定性概述遇到相同组合格品的中数字将近于相同总体水平(图1b),情况说明背部全身肌肉合格品蛋清质兼备优质的组内相拟性和组间差异形性。 血清质组学共评定出1996种血清质。以B0为对应组,选择B1、B2、B4和B6中的血清来进行地域不同传达研究解析,共评定到374个DEPs。将火山图可视化管理,并通过FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两个人基准研究解析DEP。結果描述1c-f描述,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别评定出22、33、73和140个DEPs,这之中分头别上涨6、11、32和815个,再降16、22、41和55个。聚类分析法工艺监测了多种食品冷藏过程健身肌肉群企业中血清质的传达,結果凸显健身肌肉群血清传达地域不同不断地店铺时的新增而新增(图1g)。
图1| 各种不同要在冷藏室保存时光的腿部肌肉样品管理球膳食纤维组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有所文化差异冷藏库时间段的腹肌合格品文化差异核蛋白分享(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁意外死亡淀粉酶肽的PRM一定量概述(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 依托于KEGG生物富集对比分析表示核蛋白的铁枯死长效机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱怪物提供了TMT降钙素原检测血清质组学水平保障项目,拜谱菌物已创新提交并建设了加强制度建设较为成熟的转录组学、血清组学、排泄组学各种几组学协同设备水平保障项目管理体系,欢迎致电咨询!
借鉴资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.