肾细胞癌（RCC）是世界范围内最常诊断的十种癌症之一，包括一系列广泛的组织学和遗传学亚型。明亮細胞系肾細胞系癌（ccRCC）占肾癌死亡案例的75%。虽然局部ccRCC的治疗是手术切除或消融，但疾病晚期的治疗选择受到化疗耐药性的限制，导致研究驱动的靶向治疗出现。酪氨酸激酶抑制剂和免疫检查点抑制剂的组合治疗已证明有效果。然而，这些治疗对肿瘤抑制和个体患者存活率的影响不同，这意味着需要新的选择来改善患者的预后。

2025年4月9日，新西兰华盛顿大学生的丁莉（LI Ding）院士等在Cancer Cell发表了题为“Histopathologic and proteogenomic heterogeneity reveals features of clear cell renal cell carcinoma aggressiveness”的文章。该研究对213例患者的305个ccRCC肿瘤片段和166对邻近正常组织进行了组织安排病理报告学、淀粉酶遗传基因组学和代谢转化组学的综合分析，揭示90%以上的半透组织肾组织癌的瘤内异质性、肉瘤样和横纹肌样的优点与UCHL1的效果颜值。这项研究从分子水平对侵袭性组织病理学亚型进行了分层，以提供有效的治疗策略。

论文简称：Histopathologic and proteogenomic heterogeneity reveals features of clear cell renal cell carcinoma aggressiveness

刊物：Cancer Cell

影向指数：50.3

刊发时间间隔：2023年1月

范本类型的：305个肿瘤片段和166对邻近正常组织

组学技术性：定量蛋白质组+磷酸化蛋白质组+完整糖肽蛋白质组+靶向代谢组

调查构思

探讨然而

01、单细胞膜分折检测肺部肿瘤微环镜、肉瘤样和横纹肌样表达出显著特点

我应当将213例ccRCC病列分为七种公司方面的问题学亚型，涉及到分低化ccRCC（CL）恶性恶性良性癌症、高组织开展分裂ccRCC（CH）恶性恶性良性癌症还有CH组中的肉瘤样症状组（CH-S）、横纹肌样症状组（CH-R），相结行了标准化多个学分享。通过横纹肌样、肉瘤样、多结节性和无色化等当前症状挑选了4例提高，完成snRNA-seq对18个恶性恶性良性癌症段落完成转录组学恶性恶性良性癌症内异质性（ITH）钻研。通过转录组学资料，钻研出现 了恶性恶性良性癌症和恶性恶性良性癌症微情况（TME）区室中的组织开展ITH（图1A–C）。肉瘤样组织开展分裂不是种继发性不好现象的症状，在C3N-00148中呈有所其他的节段分布范围。C3N-00148的旅途分享揭露了有所其他分枝中节段的生物丰度不同于，精准预测了seg3中恶性恶性良性癌症亚群的后面的进一步，并生物丰度了与旅途分枝相对来说应的Hippo卫星信号径路（图1D）。在C3N-01287中出现 的其它种继发性不好现象的ccRCC公司学表型（横纹肌样）与无色组织开展区串联，snRNA-seq将两类恶性恶性良性癌症症状当作有所其他的组织开展簇阻止（图1E）。

图1 双核RNA-seq图谱监定（图源：Li Y, et al., Cancer Cell, 2023）

02、甲基1亚型的DNA高甲基化与BAP1转变、低存活率重要性的优点关于

DNA甲基化标记图片的紊乱被看作是癌症复发引发的早期的活动。下第几步的泛RCC印染体遗传组的实验呈现，DNA甲基化不断增加与ccRCC能力较弱生存率两者普遍存在强锁定（图2A-B）。于是的实验员依据初始化序列数据资料进第几步探寻，依据DE剖析淘汰得出了调涨印染体遗传-UCHL1（图2C），并只能根据进第几步剖析察觉到UCHL1不光含高甲基1亚型外，还与BAP1基因变异体和wGII-high门类差异性有关的（图2D-F）。最后一个，回收利用印染法对UCHL1来进行定量分析（图2I-J）。上述情况，UCHL1在肾细胞核癌上更具肯定的生存率附加值。

图2 DNA高甲基化的甲基1亚型的显著特点（图源：Li Y, et al., Cancer Cell, 2023）

03、ccRCC蛋白质磷碱化的影响

以便确认ccRCC中首要的磷硝化作用数据信息手机预警通路，本研发确认磷硝化作用淀粉酶质组学阐述了为激酶-底物（K-S）转变的磷硝化作用数据信息线上，一般包括了110例为DIA的EXP序列病列和103例为TMT的INI序列病列（图3A）。聚类算法性阐述看到了两类最主要的的ccRCC磷硝化作用淀粉酶质组亚型（P1-P4），并确认PTM-SEA42阐述阐明了磷酸亚型的有所差异特征描述（图3B-C）。显然，研发看到了AZD-1775、TAK-228和Trametinib对神经细胞系的表现出比较的抑止反应迟钝，而Everolimus和Gefitinib对其磷硝化作用有关系数据信息的印象最大（图3D）。

图3 磷酸性反应球胆固醇组学分析一下（图源：Li Y, et al., Cancer Cell, 2023）

04、分太低化ccRCC和高差异性ccRCC蛋白酶糖基化的提升

肝癌人体细胞外面蛋清的异常的糖基化就可以的影响几种生物制品功能键，本论述能够 删改详细糖肽（IGPs）蛋清质组学介绍明确了ccRCC癌肿和NATs中5一大概调涨的IGPs和13一大概再降的IGPs（图4A）。中间，源于4类糖蛋清（FN1、FBLN5、BGN和TNC）的4类IGPs现象出鉴别癌肿和非癌肿组织化的意识（图4B）。调涨的糖肽含高岩藻糖或吐沫酸-岩藻糖聚糖，而再降的糖肽含高高聚糖、吐沫酸聚糖或各种聚糖。糖肽丰度在蛋清质水静谧糖基化双方面都深受不同的聚糖的可以调节（图4C-D）。也，按照其信息介绍出现了ccRCC三类最主要的的糖蛋清质组亚型、两个删改详细的糖肽簇同时HYOU1为继发性图标的成长性（图4E-G）。

图4 完善糖肽核营养物质组学进行分析（图源：Li Y, et al., Cancer Cell, 2023）

05、分不高化ccRCC和高变化ccRCC的细胞代谢功能

肾癌与产生态学的提升紧密有关，再程序语言的淋巴肺部肉瘤产生是癌证的一位为重要logo，最主要的功能为产生态学丰度和构成的提升。如此，实验者们对550个ccRCCs和4个NATs的各方面产生路线的183种产生态学对其进行了高置信度的程序化，察觉高档别淋巴肺部肉瘤和低等别淋巴肺部肉瘤的产生功能有有效不同之处（图5A-C）。融合产生组学和蛋白酶基因遗传组学观测到精氨酸和脯氨酸产生的有效变化无常，比如产生态学和有关酶的精氨酸生态学自动合成和尿素液循坏（图5F）。鉴于几组学了解察觉50个淋巴肺部肉瘤中含44个表现特点的表现功能，是因为ccRCC中显眼的瘤间异质性（图5H）。

图5 靶向治疗排泄组学阐述（图源：Li Y, et al., Cancer Cell, 2023）

论文总结ppt

某项设计顺利通过公司机构病检学和几组学定量分析了肾公司癌基本的特点策略。在这其中，公司机构学异质性的关察的结果与潜在性的的原子核异质性紧密涉及到，但原子核异质性也稍微超出了在见到公司机构水准上关察到的时间范围。本设计表述了肾公司癌的核高蛋白组学基本的特点，为进步设计提供了了很多的数值，能促使持续改善设计的转换，以持续改善慢性的肾公司癌的人的愈后。

拜谱生态学总结ppt

为了获得最全面的ccRCC肿瘤的信息，本研究通过多组学分析的手段整合了ccRCC不同的组织学特征，揭示了驱动ccRCC的分子机制，并为选择有效的治疗手段提供参考。拜谱生物作为组学领域的领军企业，最新引进了Orbitrap Astral质谱仪，并提升了DIA酶联免疫法高高球脂肪酸组、磷过酸突显高高球脂肪酸组、全版糖肽高高球脂肪酸组学、半胱氨酸突显高高球脂肪酸组等高高球球蛋白酶组学售后服务，为多组学联合分析打下坚实的基础，欢迎大家咨询！

符合文章：Li Y, Lih TM, Dhanasekaran SM, et al. Histopathologic and proteogenomic heterogeneity reveals features of clear cell renal cell carcinoma aggressiveness. Cancer Cell. 2023;41(1):139-163. doi: 10.1016/j.ccell.2022.12.001.